ในปี พ.ศ.2548 ศูนย์พัฒนานิติวิทยาศาสตร์ตำรวจ (ศพน.) ได้จัดตั้งขึ้น เป็นหน่วยงานระดับกองกำกับการ ภายใต้สังกัด สำนักงานนิติวิทยาศาสตร์ตำรวจ (สนง.ตร.) โดยมีวัตถุประสงค์เพื่อจัดการฝึกอบรม   และให้ความรู้แก่นักวิทยาศาสตร์สังกัด สำนักงานนิติวิทยาศาสตร์ตำรวจ และเพื่อพัฒนางานนิติวิทยาศาสตร์ตำรวจ

          ต่อมาปี พ.ศ.2552 มีพระราชกฤษฎีกาปรับปรุงโครงสร้างของสำนักงานตำรวจแห่งชาติยกฐานะศูนย์พัฒนานิติวิทยาศาสตร์ตำรวจ เป็นสถาบันฝึกอบรมและวิจัยการพิสูจน์หลักฐานตำรวจ   ซึ่งเป็นหน่วยงานระดับ กองบังคับการ มีโครงสร้างอำนาจหน้าที่ตามระเบียบสำนักงานตำรวจแห่งชาติ ว่าด้วยการกำหนดอำนาจหน้าที่ของส่วนราชการ สำนักงานตำรวจแห่งชาติ พ.ศ.2553 แบ่งส่วนเป็น

          1. ฝ่ายอำนวยการ รับผิดชอบเกี่ยวกับงานธุรการและงานสารบรรณ งานการเงิน และบัญชี งานอำนวยการต่างๆ ของหน่วย

          2. ฝ่ายฝึกอบรม มีหน้าที่ความรับผิดชอบเกี่ยวกับ งานวิชาการ งานจัดฝึกอบรม งานบริการ การศึกษางานทะเบียนและวัดผล

          3. ฝ่ายพัฒนา มีหน้าที่และความรับผิดชอบเกี่ยวกับการพัฒนาระบบบริหารการวิจัยการวางพื้นฐานเพื่อพัฒนางานวิจัยนิติวิทยาศาสตร์

          4. ฝ่ายปกครอง รับผิดชอบเกี่ยวกับการปกครอง บังคับบัญชา และให้คำปรึกษาแนะนำ แก่ผู้เข้ารับการฝึกอบรมทุกหลักสูตร ในสถานบันฝึกอบรมและวิจัยการพิสูจน์หลักฐานตำรวจ

          5. กลุ่มงานมาตรฐาน รับผิดชอบเกี่ยวกับการกำหนดแผน ควบคุมมาตรฐาน การปฤิบัติงานนิติวิทยาศาสตร์ มาตรฐานการศึกษาอบรม มาตรฐานตำแหน่ง ตลอดจนควบคุมจรรยาบรรณของ
          ผู้ตรวจพิสูจน์
          6. กลุ่มงานผู้เชี่ยวชาญ รับผิดชอบเกี่ยวกับการดำเนินการภาควิชาการ งานห้องปฏิบัติการ งานสอนวิชาต่างๆ จัดทำโปรแกรมการศึกษา สรรหาครูอาจารย์ผู้สอนและวิทยากรผู้ทรงคุณวุฒิ
          รวมถึงการผลิตตำราคำสอน และเอกสารทางวิชาการ ตลอดจนการศึกษาค้นคว้า วิจัยและพัฒนาโครงการเกี่ยวกับการตรวจพิสูจน์หลักฐานและงานทะเบียนประวัติอาชญากร